贪官扣留了黄飞鸿，限黄麒英七日内抓捕铁猴子归案。百姓们不仅没有感激黄麒英，反而骂他是走狗。黄麒英走投无路，两天没吃饭，小兰（杨大夫的助手）看他可怜，带他到医馆吃饭。黄麒英和杨大夫在饭桌上以厨艺论英雄，惺惺相惜。黄麒英向杨大夫和小兰提起儿子被关，只有抓住铁猴子才能救出。
当晚，杨大夫和小兰潜入监狱救出了黄飞鸿。黄麒英在路上遇到四个彩花贼，发现他们竟是那四个少林叛徒。他轻松击败了他们，却意外出现一个蒙面女贼，使出“大力鹰爪功”，黄麒英认出此人是少林叛徒衍空的徒弟。
黄飞鸿感染了瘟疫，杨大夫用药浴将其救醒。小兰看到黄飞鸿，想起了自己的儿子，原来她曾是妓女，杨大夫帮她接生，并收留了她。
杨大夫和小兰假扮钦差大臣来到府衙，将贪官唬住。贪官以为他们是真钦差，献上财宝，被调到其他省份。然而，在假钦差走后，真正的钦差——少林叛徒衍空大师出现了。衍空火烧少林，得到朝廷重用，此番奉命前来抓捕铁猴子。
深夜，铁猴子再次给灾民发放银子，却遭遇了衍空布下的陷阱。衍空的两位徒弟使出玉女剑法和罗汉双刀围攻铁猴子，铁猴子拿出九节鞭，很快击败了他们。然而，衍空突然从天而降，使出“大力金刚手”，将铁猴子打成重伤。铁猴子有伤在身，不敢恋战，飞檐走壁逃走。
衍空紧追不舍，却碰上了黄麒英。两人都是少林弟子，黄麒英痛恨衍空的行为，要为少林报仇。衍空嘲讽黄麒英的无影脚是“36房以外的功夫”，而黄麒英则凭借精湛的脚法，让衍空毫无还手之力。衍空只好用大力金刚手将黄麒英击退，随后又使出“风雷金刚掌”。黄麒英再次中掌，跳墙逃走。
铁猴子回到医馆，小兰为他疗伤，需要放血解毒。黄麒英也来到医馆，发现杨大夫就是铁猴子。他没有多加计较，而是写下另一份药方，让黄飞鸿去抓药救人。
衍空化出黄麒英的画像，通缉他。黄麒英和杨大夫互相救治，医好了各自的病。黄麒英仍劝杨大夫改邪归正，杨大夫讲述了父亲被贪官冤枉致死，所以他才化身铁猴子。
捕头前来搜查医馆，因与杨大夫是故交，提前通知黄麒英离开。黄麒英让黄飞鸿先回佛山，自己留下处理后续。
衍空的四个徒弟很快找上门来，此时只有小兰在家。小兰并非弱女子，她使出擒拿手，扭断了一人的手腕。四名和尚拿出武器要杀小兰，小兰找到机会抹掉了一人的脖子。然而，其中一人使出迷魂伞，小兰武力顿失。危机时刻，少年黄飞鸿从天而降，手持长棍，以一敌四。和尚故技重施，抛出迷魂伞，黄飞鸿早有察觉，一招“金蛇出动”打破药瓶，让和尚反中其毒。老尼姑也杀过来，使出“大力鹰爪功”，黄飞鸿终究年轻，被老尼姑踢翻在地，抓走了。
黄麒英和杨大夫得知黄飞鸿被抓，直接前往衙门要人。衍空逼黄飞鸿说出黄麒英下落，黄飞鸿宁死不屈。衍空要用刑，黄麒英和铁猴子及时赶到。铁猴子扔出飞镖想救黄飞鸿，衍空却使出“流云飞袖”将黄飞鸿拽了过去。
铁猴子和黄麒英联手对付衍空，小兰则救下了黄飞鸿。铁猴子让小兰和黄飞鸿先走，自己留下对付衍空。衍空再次使出流云飞袖，铁猴子用九节鞭将其打断。衍空破墙而出，拦下两人。
黄麒英不再伪装，趁两人交锋时跳到袖子上，使出“五郎八卦棍”杀向衍空。衍空的大力金刚手威力巨大，铁猴子和黄麒英轮流进攻也打不过他。两人施展绝招，仍不是其对手。黄飞鸿扔出火盆砸向衍空，导致火势蔓延。
黄麒英和铁猴子跳到木桩上，衍空紧追不舍。导演巧妙地安排了一片木桩林，让衍空最终死于剧情杀。黄麒英的无影脚和铁猴子的飞天腿都对下盘功夫要求极高，这恰恰是衍空的弱项。两人齐攻其下盘，衍空差点被打下去。两人趁胜追击，使出合体技。衍空抓住木桩，没有掉下去，他飞扑过去使出“千斤坠”，导致木桩倒塌。两人合力才化险为夷。
衍空拽起着火的木桩砸向两人，铁猴子也拿起木桩反击，黄麒英在一旁骚扰，一脚将其踢成重伤。铁猴子抓住机会将其打下木桩，但衍空轻功了得，仍没有掉下去。衍空破防了，他踢断木桩，将两人逼入绝境。最终两人只能叠罗汉站在同一根木桩上。铁猴子心生一计，故意露出破绽，逼衍空出招，反手一记“一柱定海”砸中衍空头部。最后黄麒英的无影脚终于将衍空杀死。