当时的人类并没有想到过自己将面对的是一个怎样的东西，根据当时留存的保密文件显示，【E.D.D.C】的研发团队将其称为【欧米茄晶体】，在项目主任女性科学家【M】与研究助理【S】的逐步实验下，造成巨大破坏的陨石逐渐显露出它的真身——她们发现，陨石本身存在着生命反应与庞大的能量，可以成为一种超越核聚变能的全新能源，S觉得目前接触这样的东西对于现在的人类来说还太过危险，但很显然她的上级并不那么认为……
两位研究者爆发了巨大的激烈的争执，当晚【E.D.D.C】设置于新A市大空洞附近的【欧米茄晶体】研究所发生了爆炸，几乎整个研究团队都在此全灭！原来，出于私心科学家M将自己的发现隐瞒了下来，并且盗走了处于研究阶段，90%的实验样本，在造成巨大的混乱之后M独自从【E.D.C.C】其下的研究机构逃脱，从此音讯全无。然而在此之后黑市上却突然开始流出名为【欧米茄碎片】的危险化合物，人类或者动物只要通过黏膜接触到它，肉体就会发生变异——成为与常人截然不同；拥有超凡能力的变种人。
侥幸在爆炸中逃过一劫的研究员S，通过对比实验证明这一危险的化合物的正体，乃是现今正处于研究中的【欧米茄晶体】精粹提取物，其中蕴含着难以估量的能量物质，但因为大量实验样本被M盗走的原因，研究员S的团队只从剩余的样本中提取到了少量的残骸，S深知M的性格，一旦欧米茄碎片被广泛地流通，势必会造成不可挽回的结果，正当S对此愁眉莫展之际，科学M居然再次出现在众人的视线中，此时的M舍弃了本来的名字，自称为欧米茄女皇。
由欧米茄女皇统领的变种怪人集团，侵略帝国·Ω开始对世界各地发起袭击，自封为女皇的M号称人类的未来只有接受自己的统治这是唯一的道路。看着日渐暴走的欧米茄女皇，作为M的前同僚S认为阻止她的暴行迫在眉睫，在S的再三申请下【E.D.C.C】靠着政府的支持，S组建起一支对抗Ω怪人的特别机动部队。她深知，想要对抗强大的欧米茄能量变种人必须用同样的手段制衡，经过反复试验S发明出利用装填式溶剂直接提取欧米茄能量来释放其强大生命能量的技术，赋予装着武装的人类与怪人匹敌的能力——【Core Armor星核武装】。
然而还未等S做出筹备，欧米茄女皇的军队却早已杀到跟前，情势所迫，S只得亲自担任总监，通过样本选拔，最终敲定了三位对【星核武装】持有较高适应性的适格装着者，为了防止身份暴露，S要求他们以颜色作为代号互相称呼，在三人的磨合与团结下，最终通过努力与顽强的奋战将人类从怪人统治的阴影下拯救出来！对内，他们是【E.D.C.C】的强袭先遣行动队，其行动不需要向政府报备，唯一行动准则就是救援受到怪人威胁的一般民众，而对外，【E.D.C.C】则将其称为保护星球免受威胁之人——【护星战士】！
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“呵呵……真是丢人现眼~”女人用手托着下巴，半扬起头，眼神中带着怜悯，然而下一刻她却突然瞪大了眼睛，金色的瞳孔在漆黑的环境中格外的扎眼，用单手撩起前额的刘海，用仿佛蔑视蝼蚁的眼神盯紧了三人。“可笑！！竟然以这副残兵败将的身姿出现在我的面前！！愚蠢至极，护星战士！！”疯狂的科学家M，她现在的名字是欧米茄女皇，欧米茄女皇咧着嘴角，摘下了戴在脸上的眼镜，将它高高抛起扔在了一边，抬起脚将其踩碎，然后她抓住披在身上研究者的白袍，随手一挥抛向天空，接着便如同演说家一般双手敞开着对着面前的英雄们嘲讽道：“要对付你们我连一根手指都用不到呢~~”，根本没有把面前的护星战士们放在眼里。
“小心一点，赤红、青蓝、金黄，虽然看上去狂妄而愚蠢，但这个女人曾经也是主导过【欧米茄晶体】研究实验的首脑，她对【欧米茄晶体】的了解远在我之上，绝对不是能够掉以轻心的对手……”赤红的耳机中充满知性的女性声线透过音频电波与先遣队的三人持续着联系。此时在遥远的后方，一个气质冷艳，满头乌黑长发的高挑美女，神情严肃地注视着三人面前，那嚣张得挺着巨肚的女人。
美丽的女性是机动特遣队的总监，前【欧米茄晶体研究所】所属在爆炸中生还的研究员S，她的一只眼睛戴着单片眼罩，拜爆炸所赐，她永远失去了一只眼睛的视力，S自责于当年没能阻止M的野心而酿成了当下的局面，现在的S成为【护星战士】的总指挥全力阻止着欧米茄女皇的暴行。Core Armor上装置着微型摄像头，总监就是依靠着这个S可以随时观察到前线的战况，，在他们的身后有一整个团队辅助着他们与强大的怪人变种体战斗，尽管如此，突入欧米茄实验室的战斗依旧十分的惨烈……